大家知道，有许多分子生物学软件没有windows版本，只有linux等版本，那么在windows下到底能不能运行它们呢？回答是肯定的！解决办法是下载Cygwin软件，模拟linux环境，然后再运行那些命令。

首先，下载Cygwin安装程序 点击下载

安装：

1. 双击setup.exe

2. 按照安装提示“下一步”

3. 选择从“互联网”安装：


4. 选择安装的路径，一般是C:\Cygwin，选择本地临时目录，用于存放下载的软件；选择您连接互联网的方式，一般选“直接连接”就可以了。

5. 选择下载源，您可以在下载列表里选择：http://www.cygwin.cn 或者，直接在URL里输入http://www.cygwin.cn/pub/

6. 根据安装提示，选择需要安装的软件包，完成安装。

使用

1. 双击桌面的Cygwin图标，即可启动Cygwin里的Bash。

2. 或者，你可将C:/Cygwin/bin加到%PATH%当中，您就可以直接在cmd.exe里面使用Linux命令了，比如less, cat, wc , wget

3. 如果您有一个Bash脚本，您可以直接用C:/Cygwin/bin/bash.exe X:/scripts/Monitor.sh的形式调用。