在分析基因组数据时，经常需要预测基因的RNA选择性剪切方式，即内含子和外显子的位置和数量。预测是基于RNA剪接的保守性序列“GU－AG”规则，即内含子5’端序列一般是GU，而3’端一般是AG，当然它们附近的序列也是有一定规律的，但不是很保守。根据这一特点并结合ORF, Blast等数据就可以对未知基因的成熟mRNA序列进行预测。

下面我推荐几个比较专业的RNA剪切预测网站：

1.  Augustus （功能相当强大，预测比较准确，并没有特种特异性，强烈推荐）

2. SplicePort （功能也很全面，推荐）

3. GeneSplicer （只针对以下几个物种：Plasmodium falciparum (malaria), Arabidopsis thaliana, human, Drosophila, and rice）

4. NetGene2 （只针对：Human, C. elegans, A. thaliana）

5. MaxEntScan （只针对 Human）

PS：以上只针对某某物种的不代表其它物种不支持，只是结果可能不很准确，对于同一基因，可以参考结合以上不同的服务器给出的结果。

希望以上网站对需要的朋友有所帮助，如果您有什么问题，也可以在下面留言交流。